Puzzle Box acompanha Kate, uma viciada em recuperação, que escapa para uma cabana na floresta para se recuperar. Junto com sua irmã Olivia, que decide documentar o processo, coisas estranhas começam a acontecer quando o layout da casa misteriosamente começa a mudar, e as duas se encontram presas na caixa de quebra-cabeça inescapável e indutora de pesadelos da casa.